От Пуэрто-Монт до Магелланова пролива и островов Огненной земли (Тьеро-дель-Фуэго) тянется один из самых необычных районов страны - Патагония. Климат здесь суровый, осадков выпадает относительно немного, поэтому тысячи здешних островов, фиордов и гор покрыты лесами на севере и пустошами в южной части, при этом отдельные участки несут все признаки арктической тундры - разнотравье сменяется здесь мхами и карликовыми деревьями, покрывающими горные склоны. Береговая линия сильно изрезана, многочисленные острова и фьорды образуют густую сеть взаимосвязанных акваторий. Около 30% Патагонии занято заповедниками и национальными парками, что и неудивительно - почти полная изоляция от остальных районов Южной Америки привела к развитию самых необычных форм жизни, а достаточно поздняя колонизация района позволила сохранились эти уникальные виды.

В Патагонии суровый климат. Здесь выпадает достаточно много осадков и мало солнечных дней, зимы прохладны, да и летом средняя температура не поднимается выше 18 градусов.

Одной из жемчужин региона является Национальный парк лагуны Сан-Рафаэль. Здесь, в окруженный со всех сторон ледником ("вентискерос") Сан-Валентин залив, сползают гигантские ледяные языки высотой в несколько десятков метров. Не менее интересны Национальный парк острова Магдалены (здесь обитает огромное количество пингвинов Магеллана), Национальные парки Кеулат, острова Гуамблин, Альберто-Агостини, Бернардо О'Хиггинс, Алакалуфес, Де-Уолластон и знаменитый Национальный парк Торрес-дель-Пейн (входит в список Всемирного наследия ЮНЕСКО) с его гигантскими гранитными массивами и уникальной экосистемой приполярной пампы. Очень живописны и многочисленные местные озера (Хенераль-Ибаньес, Рисопатрон, Термас-де-Пуюуапи и др.) с пустынными берегами и плавающими айсбергами. Патагония также является одним из лучших мест на планете для спортивной рыбалки.